عزل البكتريا Isolation of bacteria

المختبر الثاني
عزل البكتريا Isolation of bacteria
تحتل البكتيريا كمجموعة رئيسية من كائنات التربة مكانا بارزا فهي أكثر المجموعات تواجدا في التربة وتتفوق عددا على باقي المجاميع مجتمعة .
من المعروف ان سيادة نوع من الاحياء تتحدد تبعا للظروف البيئية السائدة فالبكتريا والفطريات تصبح سائدة في التربة عندما تتوفر ظروف تهوية مناسبة ,اما في حالة نقص الاوكسجين فان البكتريا تكون هي المسؤولة عن التغيرات الحيوية والكيميائية دون الاعفان .
تتميز البكتريا عن باقي المجاميع التي تشترك معها في نفس العمليات الحيوية في التربة بسرعة تكاثرها وقدرتها الفائقة على تحليل انواع كثيرة من المواد الطبيعية .

يمكن تقسيم بكتيريا التربة الى قسمين رئيسيين :
أ-البكتريا المتأصلة في الموطن (Indigenous) :-
تستوطن التربة بصورة طبيعية ودائمة وتساهم بفعالية في النشاطات الكيميائية الحيوية فيها . وتتميز بقدرتها على مقاومة الظروف غير المناسبة لفترات طويلة وبسرعة استجابتها لاضافة العناصر المغذية العضوية .
ب-البكتريا الدخيلة على التربة ) Invaders ) :-
تصل هذه البكتيريا الى التربة مع الامطار او الانسجة المريضة او مخلفات الانسان و الحيوان . هذه الانواع تظل حية لفترات قصيرة ولا تشارك بفعالية في عملية تحويل العناصر في التربة , كما لا تشارك في اي نوع من العلاقات مع غيرها من كائنات التربة .
وهناك انظمة اخرى للتقسيم مثل الحاجة الى الاوكسجين او شكل الخلية البكتيرية ....الخ .
يعتبر تقدير اعداد البكتيريا في التربة من الامور المعقدة لأسباب كثيرة منها عدم وجود وسط مثالي لتنمية جميع الانواع إضافة الى ان بعض الانواع لم تحدد متطلباتها تحديدا دقيقا .كذلك فان الخلايا البكتيرية عادة ما توجد في التربة على هيئة تجمعات يصعب تفتيتها بصورة متجانسة اثناء عملية الرج او الزرع مما يؤثر على التقدير الكمي لها .
تختلف اعداد البكتيريا المتحصل عليها باختلاف الطرق المتبعة في التقدير ,فقد وجد ان طريقة العد في الاطباق عادة ما تعطي أعدادا تتراوح بين عدة مئات الى 200 مليون خلية/ غم من التربة , بينما الطريقة المباشرة باستخدام المجهر العادي تعطي أعدادا تصل الى 108- 1010 خلية /غم لذلك فان طرق تقدير الميكروبات الحية تعطي ارقاما تمثل على الاكثر 10% من قيمة الاعداد الكلية.
لا توجد البكتريا حرة في محلول التربة عادة وانما ملتصقة بحبيباتها او ملتصقة بالافرازات المخاطية للبكتيريا على سطح التربة .
يؤثر نوع التربة على كثافة البكتيريا حيث تكون المناطق المزروعة أكثر احتواء على البكتيريا و بأنواع كثيرة منها وذلك نتيجة زيادة كثافة الجذور وزيادة المحتوى العضوي والرطوبة كذلك تزداد البكتريا في المناطق الدافئة.

الاجناس البكتيرية الشائعة في التربة
عند عزل وتشخيص البكتيريا الموجودة في التربة تظهر العديد من الانواع البكتيرية ومن ضمنها البكتريا العصوية المكونة للسبورات والعصوية غير المكونة للسبورات ذات الاحجام المختلفة والكروية والعصوية القصيرة التي تتحول الى الاشكال الكروية مع الوقت هي الانواع الواسعة الانتشار في التربة وهناك انواع كثيرة تتميز بظاهرة تعدد الاشكال خلال مرحلة النمو , فالأنواع العصوية القصيرة التي تتحول الى كروية عادة ما تتبع جنس Arthrobacter أما العصوية المكونة للسبورات فتتبع الجنس Bacillus وهي هوائية المعيشة او اختيارية ومنها تتبع الجنس Clostridium وهي لاهوائية اجبارية ,كذلك تنتشر أنواع تابعة ل Pseudomonas في الاراضي المزروعة وغير المزروعة , وتنتشر كذلك الانواع الرمية للجنس Corynbacterium .
يكثر وجود الانواع التي تعرف ب Myxobacteria في كل من التربة ومخلفات الحيوان الصلبة والخلايا الخضرية له عبارة عن عصيات مرنة تتحرك بالزحف , معظمها تدخل طور السكون مكونة خلايا ساكنة فوق أجسام ثمرية متخصصة وتتم دورة حياتها بخروج الخلايا العصوية من الاجسام الثمرية و تبدأ في عملية التحول الغذائي النشطة .
وتنتشر الانواع الممرضة للانسان مثل Streptpcoccus Staphylococcus Salmonella , وغيرها الممرضة للانسان مثل Agrobacterium , Erwinia وغيرها .
تعتبر البكتيريا ذاتية التغذية من أهم المجاميع الموجودة في التربة ولها دور مهم في تخصيب التربة وتغذية النباتات ومن هذه الانواع Nitrosomonas التي تؤكسد الامونيا الى نتريت و Nitrobacter التي تؤكسد النتريت الى نترات و Thiobacillus التي تحول مركبات الكبريت المعدنية الى كبريتات .